Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc1Q91Z38 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc1Q91Z38 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ttc1Q91Z38 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc1Q91Z38 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc1Q91Z38 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc1Q91Z38 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc1Q91Z38 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc1Q91Z38 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc1Q91Z38 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc1Q91Z38 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc1Q91Z38 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc1Q91Z38 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc1Q91Z38 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc1Q91Z38 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc1Q91Z38 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc1Q91Z38 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc1Q91Z38 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc1Q91Z38 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc1Q91Z38 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc1Q91Z38 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc1Q91Z38 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc1Q91Z38 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc1Q91Z38 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc1Q91Z38 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc1Q91Z38 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc1Q91Z38 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc1Q91Z38 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc1Q91Z38 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc1Q91Z38 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc1Q91Z38 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc1Q91Z38 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc1Q91Z38 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc1Q91Z38 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc1Q91Z38 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc1Q91Z38 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc1Q91Z38 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc1Q91Z38 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc1Q91Z38 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc1Q91Z38 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc1Q91Z38 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc1Q91Z38 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc1Q91Z38 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc1Q91Z38 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc1Q91Z38 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc1Q91Z38 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc1Q91Z38 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms