Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Synpo2Q91YE8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Synpo2Q91YE8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Synpo2Q91YE8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Synpo2Q91YE8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Synpo2Q91YE8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Synpo2Q91YE8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Synpo2Q91YE8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Synpo2Q91YE8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Synpo2Q91YE8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Synpo2Q91YE8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Synpo2Q91YE8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Synpo2Q91YE8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Synpo2Q91YE8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Synpo2Q91YE8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Synpo2Q91YE8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Synpo2Q91YE8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Synpo2Q91YE8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Synpo2Q91YE8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Synpo2Q91YE8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Synpo2Q91YE8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Synpo2Q91YE8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Synpo2Q91YE8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Synpo2Q91YE8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Synpo2Q91YE8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Synpo2Q91YE8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Synpo2Q91YE8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Synpo2Q91YE8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Synpo2Q91YE8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Synpo2Q91YE8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Synpo2Q91YE8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Synpo2Q91YE8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Synpo2Q91YE8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Synpo2Q91YE8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Synpo2Q91YE8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Synpo2Q91YE8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Synpo2Q91YE8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Synpo2Q91YE8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Synpo2Q91YE8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Synpo2Q91YE8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Synpo2Q91YE8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Synpo2Q91YE8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Synpo2Q91YE8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms