Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec16bQ91XT4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec16bQ91XT4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec16bQ91XT4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec16bQ91XT4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms