Protein–RNA interactions for Protein: Q91X96

Rabif, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabifQ91X96 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabifQ91X96 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabifQ91X96 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabifQ91X96 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabifQ91X96 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabifQ91X96 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabifQ91X96 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabifQ91X96 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabifQ91X96 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RabifQ91X96 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RabifQ91X96 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RabifQ91X96 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabifQ91X96 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabifQ91X96 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RabifQ91X96 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabifQ91X96 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabifQ91X96 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RabifQ91X96 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RabifQ91X96 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RabifQ91X96 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RabifQ91X96 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RabifQ91X96 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RabifQ91X96 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RabifQ91X96 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RabifQ91X96 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RabifQ91X96 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabifQ91X96 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabifQ91X96 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabifQ91X96 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabifQ91X96 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RabifQ91X96 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabifQ91X96 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RabifQ91X96 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabifQ91X96 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabifQ91X96 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabifQ91X96 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabifQ91X96 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RabifQ91X96 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RabifQ91X96 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabifQ91X96 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabifQ91X96 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabifQ91X96 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabifQ91X96 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RabifQ91X96 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RabifQ91X96 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabifQ91X96 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabifQ91X96 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabifQ91X96 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabifQ91X96 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RabifQ91X96 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabifQ91X96 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabifQ91X96 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabifQ91X96 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabifQ91X96 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabifQ91X96 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabifQ91X96 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabifQ91X96 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabifQ91X96 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabifQ91X96 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabifQ91X96 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabifQ91X96 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabifQ91X96 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabifQ91X96 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabifQ91X96 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabifQ91X96 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabifQ91X96 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabifQ91X96 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabifQ91X96 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabifQ91X96 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabifQ91X96 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabifQ91X96 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabifQ91X96 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabifQ91X96 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RabifQ91X96 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RabifQ91X96 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabifQ91X96 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabifQ91X96 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RabifQ91X96 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RabifQ91X96 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RabifQ91X96 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RabifQ91X96 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms