Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Zkscan3Q91VW9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zkscan3Q91VW9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zkscan3Q91VW9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zkscan3Q91VW9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zkscan3Q91VW9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zkscan3Q91VW9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms