Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CTTNBP2Q8WZ74 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
CTTNBP2Q8WZ74 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CTTNBP2Q8WZ74 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
CTTNBP2Q8WZ74 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
CTTNBP2Q8WZ74 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
CTTNBP2Q8WZ74 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
CTTNBP2Q8WZ74 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CTTNBP2Q8WZ74 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CTTNBP2Q8WZ74 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CTTNBP2Q8WZ74 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC42.32■■■■■ 4.37
CTTNBP2Q8WZ74 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CTTNBP2Q8WZ74 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CTTNBP2Q8WZ74 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CTTNBP2Q8WZ74 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
CTTNBP2Q8WZ74 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CTTNBP2Q8WZ74 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CTTNBP2Q8WZ74 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CTTNBP2Q8WZ74 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CTTNBP2Q8WZ74 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CTTNBP2Q8WZ74 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CTTNBP2Q8WZ74 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CTTNBP2Q8WZ74 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CTTNBP2Q8WZ74 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CTTNBP2Q8WZ74 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CTTNBP2Q8WZ74 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CTTNBP2Q8WZ74 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CTTNBP2Q8WZ74 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CTTNBP2Q8WZ74 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CTTNBP2Q8WZ74 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CTTNBP2Q8WZ74 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CTTNBP2Q8WZ74 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CTTNBP2Q8WZ74 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CTTNBP2Q8WZ74 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
CTTNBP2Q8WZ74 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CTTNBP2Q8WZ74 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
CTTNBP2Q8WZ74 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CTTNBP2Q8WZ74 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CTTNBP2Q8WZ74 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CTTNBP2Q8WZ74 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CTTNBP2Q8WZ74 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CTTNBP2Q8WZ74 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CTTNBP2Q8WZ74 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CTTNBP2Q8WZ74 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CTTNBP2Q8WZ74 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CTTNBP2Q8WZ74 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CTTNBP2Q8WZ74 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CTTNBP2Q8WZ74 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CTTNBP2Q8WZ74 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CTTNBP2Q8WZ74 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CTTNBP2Q8WZ74 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CTTNBP2Q8WZ74 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CTTNBP2Q8WZ74 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CTTNBP2Q8WZ74 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CTTNBP2Q8WZ74 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
CTTNBP2Q8WZ74 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC42■■■■■ 4.31
CTTNBP2Q8WZ74 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CTTNBP2Q8WZ74 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
CTTNBP2Q8WZ74 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CTTNBP2Q8WZ74 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
CTTNBP2Q8WZ74 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CTTNBP2Q8WZ74 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CTTNBP2Q8WZ74 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CTTNBP2Q8WZ74 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
CTTNBP2Q8WZ74 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CTTNBP2Q8WZ74 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
CTTNBP2Q8WZ74 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CTTNBP2Q8WZ74 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CTTNBP2Q8WZ74 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms