Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL1Q8WXF7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL1Q8WXF7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL1Q8WXF7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL1Q8WXF7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL1Q8WXF7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL1Q8WXF7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATL1Q8WXF7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATL1Q8WXF7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATL1Q8WXF7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL1Q8WXF7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL1Q8WXF7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATL1Q8WXF7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATL1Q8WXF7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATL1Q8WXF7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL1Q8WXF7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms