Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DEPDC1BQ8WUY9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DEPDC1BQ8WUY9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DEPDC1BQ8WUY9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DEPDC1BQ8WUY9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DEPDC1BQ8WUY9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms