Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm4cQ8VCD7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm4cQ8VCD7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm4cQ8VCD7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm4cQ8VCD7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm4cQ8VCD7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm4cQ8VCD7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm4cQ8VCD7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm4cQ8VCD7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm4cQ8VCD7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm4cQ8VCD7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm4cQ8VCD7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm4cQ8VCD7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm4cQ8VCD7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm4cQ8VCD7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm4cQ8VCD7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm4cQ8VCD7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm4cQ8VCD7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm4cQ8VCD7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm4cQ8VCD7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm4cQ8VCD7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm4cQ8VCD7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm4cQ8VCD7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm4cQ8VCD7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm4cQ8VCD7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm4cQ8VCD7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm4cQ8VCD7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm4cQ8VCD7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm4cQ8VCD7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm4cQ8VCD7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm4cQ8VCD7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm4cQ8VCD7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm4cQ8VCD7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm4cQ8VCD7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm4cQ8VCD7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm4cQ8VCD7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm4cQ8VCD7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm4cQ8VCD7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm4cQ8VCD7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms