Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTRT2Q8TDY3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTRT2Q8TDY3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTRT2Q8TDY3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTRT2Q8TDY3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTRT2Q8TDY3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTRT2Q8TDY3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTRT2Q8TDY3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTRT2Q8TDY3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTRT2Q8TDY3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTRT2Q8TDY3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTRT2Q8TDY3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTRT2Q8TDY3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTRT2Q8TDY3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTRT2Q8TDY3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTRT2Q8TDY3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTRT2Q8TDY3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTRT2Q8TDY3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT2Q8TDY3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACTRT2Q8TDY3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms