Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR2

STK35, Serine/threonine-protein kinase 35, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STK35Q8TDR2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STK35Q8TDR2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STK35Q8TDR2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STK35Q8TDR2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STK35Q8TDR2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STK35Q8TDR2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STK35Q8TDR2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STK35Q8TDR2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STK35Q8TDR2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms