Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ1

CD300LF, CMRF35-like molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300LFQ8TDQ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD300LFQ8TDQ1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD300LFQ8TDQ1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD300LFQ8TDQ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD300LFQ8TDQ1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD300LFQ8TDQ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD300LFQ8TDQ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD300LFQ8TDQ1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD300LFQ8TDQ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD300LFQ8TDQ1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD300LFQ8TDQ1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD300LFQ8TDQ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD300LFQ8TDQ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD300LFQ8TDQ1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD300LFQ8TDQ1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD300LFQ8TDQ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CD300LFQ8TDQ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD300LFQ8TDQ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300LFQ8TDQ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.4 ms