Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HELQQ8TDG4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HELQQ8TDG4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HELQQ8TDG4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HELQQ8TDG4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELQQ8TDG4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELQQ8TDG4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HELQQ8TDG4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HELQQ8TDG4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HELQQ8TDG4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HELQQ8TDG4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELQQ8TDG4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELQQ8TDG4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELQQ8TDG4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HELQQ8TDG4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HELQQ8TDG4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HELQQ8TDG4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HELQQ8TDG4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HELQQ8TDG4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HELQQ8TDG4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HELQQ8TDG4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HELQQ8TDG4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HELQQ8TDG4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HELQQ8TDG4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELQQ8TDG4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELQQ8TDG4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HELQQ8TDG4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HELQQ8TDG4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HELQQ8TDG4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms