Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGR3Q8TD06 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGR3Q8TD06 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGR3Q8TD06 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms