Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC41

RNF217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF217Q8TC41 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF217Q8TC41 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF217Q8TC41 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF217Q8TC41 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF217Q8TC41 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms