Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STAG3L4Q8TBR4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
STAG3L4Q8TBR4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
STAG3L4Q8TBR4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAG3L4Q8TBR4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG3L4Q8TBR4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L4Q8TBR4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3L4Q8TBR4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3L4Q8TBR4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3L4Q8TBR4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3L4Q8TBR4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3L4Q8TBR4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3L4Q8TBR4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3L4Q8TBR4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3L4Q8TBR4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3L4Q8TBR4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3L4Q8TBR4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3L4Q8TBR4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG3L4Q8TBR4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG3L4Q8TBR4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG3L4Q8TBR4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG3L4Q8TBR4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG3L4Q8TBR4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms