Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9orf43Q8TAL5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C9orf43Q8TAL5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C9orf43Q8TAL5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9orf43Q8TAL5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9orf43Q8TAL5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9orf43Q8TAL5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf43Q8TAL5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf43Q8TAL5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf43Q8TAL5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf43Q8TAL5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf43Q8TAL5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf43Q8TAL5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf43Q8TAL5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf43Q8TAL5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf43Q8TAL5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf43Q8TAL5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf43Q8TAL5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf43Q8TAL5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf43Q8TAL5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf43Q8TAL5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf43Q8TAL5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf43Q8TAL5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf43Q8TAL5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf43Q8TAL5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf43Q8TAL5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf43Q8TAL5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9orf43Q8TAL5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf43Q8TAL5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf43Q8TAL5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf43Q8TAL5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms