Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slf1Q8R3P9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slf1Q8R3P9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slf1Q8R3P9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slf1Q8R3P9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slf1Q8R3P9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slf1Q8R3P9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slf1Q8R3P9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slf1Q8R3P9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Slf1Q8R3P9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slf1Q8R3P9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slf1Q8R3P9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slf1Q8R3P9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slf1Q8R3P9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slf1Q8R3P9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slf1Q8R3P9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Slf1Q8R3P9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slf1Q8R3P9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slf1Q8R3P9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slf1Q8R3P9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slf1Q8R3P9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slf1Q8R3P9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slf1Q8R3P9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slf1Q8R3P9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slf1Q8R3P9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slf1Q8R3P9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slf1Q8R3P9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slf1Q8R3P9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slf1Q8R3P9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slf1Q8R3P9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slf1Q8R3P9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slf1Q8R3P9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms