Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATL2Q8NHH9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATL2Q8NHH9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATL2Q8NHH9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATL2Q8NHH9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATL2Q8NHH9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATL2Q8NHH9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATL2Q8NHH9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATL2Q8NHH9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATL2Q8NHH9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATL2Q8NHH9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATL2Q8NHH9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATL2Q8NHH9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATL2Q8NHH9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATL2Q8NHH9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATL2Q8NHH9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATL2Q8NHH9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms