Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLGN4YQ8NFZ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLGN4YQ8NFZ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NLGN4YQ8NFZ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLGN4YQ8NFZ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLGN4YQ8NFZ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLGN4YQ8NFZ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLGN4YQ8NFZ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLGN4YQ8NFZ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLGN4YQ8NFZ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.5 ms