Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA6DQ8NFY4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA6DQ8NFY4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6DQ8NFY4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms