Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
APPL2Q8NEU8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APPL2Q8NEU8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APPL2Q8NEU8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APPL2Q8NEU8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APPL2Q8NEU8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APPL2Q8NEU8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
APPL2Q8NEU8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APPL2Q8NEU8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APPL2Q8NEU8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APPL2Q8NEU8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APPL2Q8NEU8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APPL2Q8NEU8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APPL2Q8NEU8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APPL2Q8NEU8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APPL2Q8NEU8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APPL2Q8NEU8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APPL2Q8NEU8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
APPL2Q8NEU8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APPL2Q8NEU8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APPL2Q8NEU8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APPL2Q8NEU8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APPL2Q8NEU8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
APPL2Q8NEU8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APPL2Q8NEU8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APPL2Q8NEU8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APPL2Q8NEU8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APPL2Q8NEU8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APPL2Q8NEU8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APPL2Q8NEU8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APPL2Q8NEU8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms