Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC112Q8NEF3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC112Q8NEF3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC112Q8NEF3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC112Q8NEF3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC112Q8NEF3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC112Q8NEF3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC112Q8NEF3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms