Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BBOF1Q8ND07 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BBOF1Q8ND07 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
BBOF1Q8ND07 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BBOF1Q8ND07 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BBOF1Q8ND07 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms