Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9R8

SCAI, Protein SCAI, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAIQ8N9R8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAIQ8N9R8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCAIQ8N9R8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAIQ8N9R8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAIQ8N9R8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAIQ8N9R8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAIQ8N9R8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms