Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C10orf53Q8N6V4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf53Q8N6V4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf53Q8N6V4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf53Q8N6V4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf53Q8N6V4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C10orf53Q8N6V4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C10orf53Q8N6V4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C10orf53Q8N6V4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C10orf53Q8N6V4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C10orf53Q8N6V4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C10orf53Q8N6V4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C10orf53Q8N6V4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C10orf53Q8N6V4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C10orf53Q8N6V4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C10orf53Q8N6V4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C10orf53Q8N6V4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C10orf53Q8N6V4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C10orf53Q8N6V4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C10orf53Q8N6V4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf53Q8N6V4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf53Q8N6V4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf53Q8N6V4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf53Q8N6V4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf53Q8N6V4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf53Q8N6V4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf53Q8N6V4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf53Q8N6V4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf53Q8N6V4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf53Q8N6V4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf53Q8N6V4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf53Q8N6V4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf53Q8N6V4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms