Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZCCHC9Q8N567 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZCCHC9Q8N567 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZCCHC9Q8N567 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZCCHC9Q8N567 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZCCHC9Q8N567 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZCCHC9Q8N567 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZCCHC9Q8N567 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZCCHC9Q8N567 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZCCHC9Q8N567 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZCCHC9Q8N567 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZCCHC9Q8N567 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZCCHC9Q8N567 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZCCHC9Q8N567 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZCCHC9Q8N567 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZCCHC9Q8N567 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZCCHC9Q8N567 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZCCHC9Q8N567 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZCCHC9Q8N567 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZCCHC9Q8N567 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZCCHC9Q8N567 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZCCHC9Q8N567 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZCCHC9Q8N567 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZCCHC9Q8N567 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZCCHC9Q8N567 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZCCHC9Q8N567 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZCCHC9Q8N567 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms