Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC43Q8N309 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC43Q8N309 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC43Q8N309 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC43Q8N309 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC43Q8N309 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC43Q8N309 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC43Q8N309 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC43Q8N309 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC43Q8N309 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC43Q8N309 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC43Q8N309 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC43Q8N309 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC43Q8N309 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC43Q8N309 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC43Q8N309 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC43Q8N309 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC43Q8N309 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC43Q8N309 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC43Q8N309 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC43Q8N309 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC43Q8N309 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC43Q8N309 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC43Q8N309 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC43Q8N309 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC43Q8N309 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC43Q8N309 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC43Q8N309 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC43Q8N309 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC43Q8N309 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC43Q8N309 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC43Q8N309 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC43Q8N309 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC43Q8N309 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC43Q8N309 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC43Q8N309 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC43Q8N309 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC43Q8N309 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC43Q8N309 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC43Q8N309 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC43Q8N309 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC43Q8N309 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC43Q8N309 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC43Q8N309 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC43Q8N309 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC43Q8N309 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC43Q8N309 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC43Q8N309 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms