Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA5Q8N114 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA5Q8N114 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SHISA5Q8N114 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHISA5Q8N114 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHISA5Q8N114 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHISA5Q8N114 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHISA5Q8N114 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SHISA5Q8N114 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SHISA5Q8N114 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SHISA5Q8N114 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHISA5Q8N114 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHISA5Q8N114 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHISA5Q8N114 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHISA5Q8N114 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHISA5Q8N114 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms