Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4S1

Plce1, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 2,282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plce1Q8K4S1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plce1Q8K4S1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Plce1Q8K4S1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Plce1Q8K4S1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Plce1Q8K4S1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plce1Q8K4S1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plce1Q8K4S1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plce1Q8K4S1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plce1Q8K4S1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plce1Q8K4S1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plce1Q8K4S1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plce1Q8K4S1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plce1Q8K4S1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plce1Q8K4S1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plce1Q8K4S1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plce1Q8K4S1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plce1Q8K4S1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Plce1Q8K4S1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Plce1Q8K4S1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Plce1Q8K4S1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plce1Q8K4S1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plce1Q8K4S1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plce1Q8K4S1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plce1Q8K4S1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plce1Q8K4S1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plce1Q8K4S1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plce1Q8K4S1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Plce1Q8K4S1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plce1Q8K4S1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plce1Q8K4S1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Plce1Q8K4S1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Plce1Q8K4S1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plce1Q8K4S1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plce1Q8K4S1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plce1Q8K4S1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plce1Q8K4S1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plce1Q8K4S1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plce1Q8K4S1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plce1Q8K4S1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plce1Q8K4S1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plce1Q8K4S1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plce1Q8K4S1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plce1Q8K4S1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plce1Q8K4S1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plce1Q8K4S1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plce1Q8K4S1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Plce1Q8K4S1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plce1Q8K4S1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms