Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pof1bQ8K4L4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pof1bQ8K4L4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pof1bQ8K4L4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pof1bQ8K4L4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pof1bQ8K4L4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pof1bQ8K4L4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pof1bQ8K4L4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pof1bQ8K4L4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pof1bQ8K4L4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pof1bQ8K4L4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pof1bQ8K4L4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pof1bQ8K4L4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pof1bQ8K4L4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pof1bQ8K4L4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pof1bQ8K4L4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pof1bQ8K4L4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pof1bQ8K4L4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pof1bQ8K4L4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pof1bQ8K4L4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pof1bQ8K4L4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pof1bQ8K4L4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pof1bQ8K4L4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pof1bQ8K4L4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pof1bQ8K4L4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pof1bQ8K4L4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pof1bQ8K4L4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pof1bQ8K4L4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Pof1bQ8K4L4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pof1bQ8K4L4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pof1bQ8K4L4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pof1bQ8K4L4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pof1bQ8K4L4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pof1bQ8K4L4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pof1bQ8K4L4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pof1bQ8K4L4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pof1bQ8K4L4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pof1bQ8K4L4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pof1bQ8K4L4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pof1bQ8K4L4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pof1bQ8K4L4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Pof1bQ8K4L4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pof1bQ8K4L4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Pof1bQ8K4L4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pof1bQ8K4L4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pof1bQ8K4L4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pof1bQ8K4L4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pof1bQ8K4L4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pof1bQ8K4L4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pof1bQ8K4L4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pof1bQ8K4L4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pof1bQ8K4L4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pof1bQ8K4L4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pof1bQ8K4L4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pof1bQ8K4L4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pof1bQ8K4L4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pof1bQ8K4L4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pof1bQ8K4L4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pof1bQ8K4L4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pof1bQ8K4L4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pof1bQ8K4L4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pof1bQ8K4L4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pof1bQ8K4L4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pof1bQ8K4L4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pof1bQ8K4L4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pof1bQ8K4L4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pof1bQ8K4L4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pof1bQ8K4L4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pof1bQ8K4L4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pof1bQ8K4L4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pof1bQ8K4L4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pof1bQ8K4L4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pof1bQ8K4L4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pof1bQ8K4L4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pof1bQ8K4L4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pof1bQ8K4L4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pof1bQ8K4L4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pof1bQ8K4L4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pof1bQ8K4L4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pof1bQ8K4L4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pof1bQ8K4L4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pof1bQ8K4L4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms