Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gtf3c1Q8K284 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c1Q8K284 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c1Q8K284 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c1Q8K284 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c1Q8K284 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c1Q8K284 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf3c1Q8K284 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c1Q8K284 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c1Q8K284 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c1Q8K284 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c1Q8K284 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c1Q8K284 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c1Q8K284 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c1Q8K284 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c1Q8K284 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c1Q8K284 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c1Q8K284 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c1Q8K284 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf3c1Q8K284 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c1Q8K284 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf3c1Q8K284 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c1Q8K284 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c1Q8K284 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c1Q8K284 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c1Q8K284 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c1Q8K284 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c1Q8K284 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c1Q8K284 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c1Q8K284 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c1Q8K284 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c1Q8K284 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms