Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkd3Q8K1Y2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkd3Q8K1Y2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkd3Q8K1Y2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkd3Q8K1Y2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkd3Q8K1Y2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkd3Q8K1Y2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkd3Q8K1Y2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkd3Q8K1Y2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkd3Q8K1Y2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkd3Q8K1Y2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prkd3Q8K1Y2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkd3Q8K1Y2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkd3Q8K1Y2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms