Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
SYCP3Q8IZU3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP3Q8IZU3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP3Q8IZU3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP3Q8IZU3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP3Q8IZU3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP3Q8IZU3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP3Q8IZU3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP3Q8IZU3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP3Q8IZU3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP3Q8IZU3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP3Q8IZU3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SYCP3Q8IZU3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP3Q8IZU3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP3Q8IZU3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP3Q8IZU3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP3Q8IZU3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP3Q8IZU3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP3Q8IZU3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP3Q8IZU3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYCP3Q8IZU3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP3Q8IZU3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP3Q8IZU3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYCP3Q8IZU3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYCP3Q8IZU3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYCP3Q8IZU3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP3Q8IZU3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP3Q8IZU3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP3Q8IZU3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms