Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA2D3Q8IZS8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA2D3Q8IZS8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA2D3Q8IZS8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA2D3Q8IZS8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA2D3Q8IZS8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNA2D3Q8IZS8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNA2D3Q8IZS8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA2D3Q8IZS8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA2D3Q8IZS8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA2D3Q8IZS8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA2D3Q8IZS8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms