Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HACE1Q8IYU2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HACE1Q8IYU2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HACE1Q8IYU2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HACE1Q8IYU2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HACE1Q8IYU2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HACE1Q8IYU2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HACE1Q8IYU2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HACE1Q8IYU2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HACE1Q8IYU2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HACE1Q8IYU2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HACE1Q8IYU2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HACE1Q8IYU2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HACE1Q8IYU2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HACE1Q8IYU2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HACE1Q8IYU2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HACE1Q8IYU2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HACE1Q8IYU2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HACE1Q8IYU2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HACE1Q8IYU2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HACE1Q8IYU2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HACE1Q8IYU2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HACE1Q8IYU2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HACE1Q8IYU2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HACE1Q8IYU2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HACE1Q8IYU2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HACE1Q8IYU2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HACE1Q8IYU2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HACE1Q8IYU2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HACE1Q8IYU2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HACE1Q8IYU2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HACE1Q8IYU2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HACE1Q8IYU2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HACE1Q8IYU2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HACE1Q8IYU2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HACE1Q8IYU2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HACE1Q8IYU2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HACE1Q8IYU2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HACE1Q8IYU2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HACE1Q8IYU2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HACE1Q8IYU2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HACE1Q8IYU2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HACE1Q8IYU2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HACE1Q8IYU2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HACE1Q8IYU2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HACE1Q8IYU2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HACE1Q8IYU2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HACE1Q8IYU2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HACE1Q8IYU2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HACE1Q8IYU2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HACE1Q8IYU2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HACE1Q8IYU2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HACE1Q8IYU2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HACE1Q8IYU2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HACE1Q8IYU2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HACE1Q8IYU2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HACE1Q8IYU2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HACE1Q8IYU2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms