Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN4Q8IWV2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN4Q8IWV2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN4Q8IWV2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTN4Q8IWV2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN4Q8IWV2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms