Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC103Q8IW40 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC103Q8IW40 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC103Q8IW40 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC103Q8IW40 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC103Q8IW40 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC103Q8IW40 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC103Q8IW40 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC103Q8IW40 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC103Q8IW40 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC103Q8IW40 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC103Q8IW40 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC103Q8IW40 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC103Q8IW40 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC103Q8IW40 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms