Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KSR1Q8IVT5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KSR1Q8IVT5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KSR1Q8IVT5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KSR1Q8IVT5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KSR1Q8IVT5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KSR1Q8IVT5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KSR1Q8IVT5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KSR1Q8IVT5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KSR1Q8IVT5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KSR1Q8IVT5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KSR1Q8IVT5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KSR1Q8IVT5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KSR1Q8IVT5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KSR1Q8IVT5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KSR1Q8IVT5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KSR1Q8IVT5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KSR1Q8IVT5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KSR1Q8IVT5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KSR1Q8IVT5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KSR1Q8IVT5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KSR1Q8IVT5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KSR1Q8IVT5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KSR1Q8IVT5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KSR1Q8IVT5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KSR1Q8IVT5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KSR1Q8IVT5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KSR1Q8IVT5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KSR1Q8IVT5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KSR1Q8IVT5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KSR1Q8IVT5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KSR1Q8IVT5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KSR1Q8IVT5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KSR1Q8IVT5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KSR1Q8IVT5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms