Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNGA4Q8IV77 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGA4Q8IV77 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNGA4Q8IV77 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGA4Q8IV77 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.1 ms