Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC71Q8IV32 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC71Q8IV32 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC71Q8IV32 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC71Q8IV32 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC71Q8IV32 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC71Q8IV32 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC71Q8IV32 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC71Q8IV32 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC71Q8IV32 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC71Q8IV32 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC71Q8IV32 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC71Q8IV32 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC71Q8IV32 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC71Q8IV32 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC71Q8IV32 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC71Q8IV32 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC71Q8IV32 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC71Q8IV32 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC71Q8IV32 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms