Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUK5

PLXDC1, Plexin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXDC1Q8IUK5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXDC1Q8IUK5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXDC1Q8IUK5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXDC1Q8IUK5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXDC1Q8IUK5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXDC1Q8IUK5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXDC1Q8IUK5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXDC1Q8IUK5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PLXDC1Q8IUK5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLXDC1Q8IUK5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXDC1Q8IUK5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLXDC1Q8IUK5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms