Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRLF3Q8IUI8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRLF3Q8IUI8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRLF3Q8IUI8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRLF3Q8IUI8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms