Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIV8

Tbce, Tubulin-specific chaperone E, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbceQ8CIV8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TbceQ8CIV8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TbceQ8CIV8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TbceQ8CIV8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbceQ8CIV8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbceQ8CIV8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbceQ8CIV8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbceQ8CIV8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbceQ8CIV8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TbceQ8CIV8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TbceQ8CIV8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TbceQ8CIV8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TbceQ8CIV8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TbceQ8CIV8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TbceQ8CIV8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TbceQ8CIV8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TbceQ8CIV8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TbceQ8CIV8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TbceQ8CIV8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TbceQ8CIV8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TbceQ8CIV8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TbceQ8CIV8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TbceQ8CIV8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TbceQ8CIV8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TbceQ8CIV8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TbceQ8CIV8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TbceQ8CIV8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TbceQ8CIV8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbceQ8CIV8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbceQ8CIV8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TbceQ8CIV8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TbceQ8CIV8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TbceQ8CIV8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TbceQ8CIV8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TbceQ8CIV8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TbceQ8CIV8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TbceQ8CIV8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.8 ms