Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrif1Q8CDD9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrif1Q8CDD9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrif1Q8CDD9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrif1Q8CDD9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrif1Q8CDD9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrif1Q8CDD9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrif1Q8CDD9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrif1Q8CDD9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrif1Q8CDD9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrif1Q8CDD9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrif1Q8CDD9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrif1Q8CDD9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrif1Q8CDD9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrif1Q8CDD9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrif1Q8CDD9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrif1Q8CDD9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrif1Q8CDD9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrif1Q8CDD9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrif1Q8CDD9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrif1Q8CDD9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrif1Q8CDD9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrif1Q8CDD9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrif1Q8CDD9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrif1Q8CDD9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrif1Q8CDD9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrif1Q8CDD9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrif1Q8CDD9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrif1Q8CDD9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrif1Q8CDD9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrif1Q8CDD9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrif1Q8CDD9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrif1Q8CDD9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrif1Q8CDD9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrif1Q8CDD9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrif1Q8CDD9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrif1Q8CDD9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrif1Q8CDD9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrif1Q8CDD9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrif1Q8CDD9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrif1Q8CDD9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrif1Q8CDD9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrif1Q8CDD9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrif1Q8CDD9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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