Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
E4f1Q8CCE9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
E4f1Q8CCE9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
E4f1Q8CCE9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
E4f1Q8CCE9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
E4f1Q8CCE9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
E4f1Q8CCE9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
E4f1Q8CCE9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
E4f1Q8CCE9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
E4f1Q8CCE9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
E4f1Q8CCE9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
E4f1Q8CCE9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
E4f1Q8CCE9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E4f1Q8CCE9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
E4f1Q8CCE9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E4f1Q8CCE9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
E4f1Q8CCE9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
E4f1Q8CCE9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
E4f1Q8CCE9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
E4f1Q8CCE9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
E4f1Q8CCE9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
E4f1Q8CCE9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
E4f1Q8CCE9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
E4f1Q8CCE9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
E4f1Q8CCE9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
E4f1Q8CCE9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
E4f1Q8CCE9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
E4f1Q8CCE9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
E4f1Q8CCE9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E4f1Q8CCE9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E4f1Q8CCE9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E4f1Q8CCE9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
E4f1Q8CCE9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
E4f1Q8CCE9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
E4f1Q8CCE9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
E4f1Q8CCE9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
E4f1Q8CCE9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
E4f1Q8CCE9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
E4f1Q8CCE9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E4f1Q8CCE9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
E4f1Q8CCE9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
E4f1Q8CCE9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
E4f1Q8CCE9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
E4f1Q8CCE9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
E4f1Q8CCE9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
E4f1Q8CCE9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
E4f1Q8CCE9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
E4f1Q8CCE9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
E4f1Q8CCE9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
E4f1Q8CCE9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
E4f1Q8CCE9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
E4f1Q8CCE9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
E4f1Q8CCE9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
E4f1Q8CCE9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E4f1Q8CCE9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E4f1Q8CCE9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
E4f1Q8CCE9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
E4f1Q8CCE9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
E4f1Q8CCE9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
E4f1Q8CCE9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
E4f1Q8CCE9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
E4f1Q8CCE9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
E4f1Q8CCE9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
E4f1Q8CCE9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
E4f1Q8CCE9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
E4f1Q8CCE9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
E4f1Q8CCE9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
E4f1Q8CCE9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
E4f1Q8CCE9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
E4f1Q8CCE9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
E4f1Q8CCE9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
E4f1Q8CCE9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
E4f1Q8CCE9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
E4f1Q8CCE9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
E4f1Q8CCE9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
E4f1Q8CCE9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
E4f1Q8CCE9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
E4f1Q8CCE9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
E4f1Q8CCE9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
E4f1Q8CCE9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms