Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bhlhe22Q8C6A8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bhlhe22Q8C6A8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bhlhe22Q8C6A8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bhlhe22Q8C6A8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bhlhe22Q8C6A8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bhlhe22Q8C6A8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bhlhe22Q8C6A8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bhlhe22Q8C6A8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bhlhe22Q8C6A8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bhlhe22Q8C6A8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bhlhe22Q8C6A8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bhlhe22Q8C6A8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bhlhe22Q8C6A8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bhlhe22Q8C6A8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bhlhe22Q8C6A8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bhlhe22Q8C6A8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bhlhe22Q8C6A8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bhlhe22Q8C6A8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bhlhe22Q8C6A8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bhlhe22Q8C6A8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bhlhe22Q8C6A8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bhlhe22Q8C6A8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bhlhe22Q8C6A8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bhlhe22Q8C6A8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bhlhe22Q8C6A8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bhlhe22Q8C6A8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms