Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXV2

Bri3bp, BRI3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bri3bpQ8BXV2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bri3bpQ8BXV2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bri3bpQ8BXV2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bri3bpQ8BXV2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bri3bpQ8BXV2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bri3bpQ8BXV2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Bri3bpQ8BXV2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bri3bpQ8BXV2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bri3bpQ8BXV2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bri3bpQ8BXV2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bri3bpQ8BXV2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Bri3bpQ8BXV2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bri3bpQ8BXV2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bri3bpQ8BXV2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bri3bpQ8BXV2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bri3bpQ8BXV2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bri3bpQ8BXV2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bri3bpQ8BXV2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Bri3bpQ8BXV2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bri3bpQ8BXV2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bri3bpQ8BXV2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bri3bpQ8BXV2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bri3bpQ8BXV2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bri3bpQ8BXV2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bri3bpQ8BXV2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bri3bpQ8BXV2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bri3bpQ8BXV2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bri3bpQ8BXV2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Bri3bpQ8BXV2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bri3bpQ8BXV2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bri3bpQ8BXV2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bri3bpQ8BXV2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bri3bpQ8BXV2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bri3bpQ8BXV2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bri3bpQ8BXV2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bri3bpQ8BXV2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Bri3bpQ8BXV2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Bri3bpQ8BXV2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Bri3bpQ8BXV2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bri3bpQ8BXV2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bri3bpQ8BXV2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bri3bpQ8BXV2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Bri3bpQ8BXV2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bri3bpQ8BXV2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bri3bpQ8BXV2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bri3bpQ8BXV2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bri3bpQ8BXV2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bri3bpQ8BXV2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bri3bpQ8BXV2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bri3bpQ8BXV2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bri3bpQ8BXV2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bri3bpQ8BXV2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bri3bpQ8BXV2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bri3bpQ8BXV2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bri3bpQ8BXV2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bri3bpQ8BXV2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bri3bpQ8BXV2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bri3bpQ8BXV2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bri3bpQ8BXV2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bri3bpQ8BXV2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bri3bpQ8BXV2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bri3bpQ8BXV2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bri3bpQ8BXV2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bri3bpQ8BXV2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bri3bpQ8BXV2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bri3bpQ8BXV2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bri3bpQ8BXV2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bri3bpQ8BXV2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bri3bpQ8BXV2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Bri3bpQ8BXV2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Bri3bpQ8BXV2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bri3bpQ8BXV2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bri3bpQ8BXV2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bri3bpQ8BXV2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bri3bpQ8BXV2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bri3bpQ8BXV2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bri3bpQ8BXV2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bri3bpQ8BXV2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bri3bpQ8BXV2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Bri3bpQ8BXV2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.9 ms