Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXN9

Tmem87a, Transmembrane protein 87A, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87aQ8BXN9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmem87aQ8BXN9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmem87aQ8BXN9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmem87aQ8BXN9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmem87aQ8BXN9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmem87aQ8BXN9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tmem87aQ8BXN9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tmem87aQ8BXN9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmem87aQ8BXN9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmem87aQ8BXN9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem87aQ8BXN9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmem87aQ8BXN9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmem87aQ8BXN9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmem87aQ8BXN9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmem87aQ8BXN9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmem87aQ8BXN9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmem87aQ8BXN9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem87aQ8BXN9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem87aQ8BXN9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem87aQ8BXN9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmem87aQ8BXN9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmem87aQ8BXN9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmem87aQ8BXN9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem87aQ8BXN9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmem87aQ8BXN9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmem87aQ8BXN9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmem87aQ8BXN9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmem87aQ8BXN9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmem87aQ8BXN9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmem87aQ8BXN9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmem87aQ8BXN9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmem87aQ8BXN9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmem87aQ8BXN9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmem87aQ8BXN9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmem87aQ8BXN9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmem87aQ8BXN9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmem87aQ8BXN9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms