Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Als2cr12Q8BVM7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Als2cr12Q8BVM7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Als2cr12Q8BVM7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Als2cr12Q8BVM7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Als2cr12Q8BVM7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Als2cr12Q8BVM7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Als2cr12Q8BVM7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Als2cr12Q8BVM7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Als2cr12Q8BVM7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Als2cr12Q8BVM7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Als2cr12Q8BVM7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Als2cr12Q8BVM7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Als2cr12Q8BVM7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Als2cr12Q8BVM7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Als2cr12Q8BVM7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Als2cr12Q8BVM7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Als2cr12Q8BVM7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Als2cr12Q8BVM7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Als2cr12Q8BVM7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Als2cr12Q8BVM7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Als2cr12Q8BVM7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Als2cr12Q8BVM7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Als2cr12Q8BVM7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Als2cr12Q8BVM7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Als2cr12Q8BVM7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Als2cr12Q8BVM7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Als2cr12Q8BVM7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Als2cr12Q8BVM7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Als2cr12Q8BVM7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Als2cr12Q8BVM7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Als2cr12Q8BVM7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms